I. Kılıç Arslan döneminde Anadolu batısı bölgelerinde İzmir’i ele geçiren ve kendi donanmasını kuran yeni bir Türk beyi olan Çaka Bey isminden sık sık söz ettirmeye başlamıştı. Çaka Bey’in zaman geçtikçe gücünü daha da arttırması ve bölgede etkili nüfuz sahibi olması üstüne I. Sultan Kılıç Arslan ortak düşmanları Bizans’a karşı Çaka Bey ile birlik olmaya çalışarak, Çaka Bey’in kızıyla 1092 tarihinde diplomatik amacı olan bir evlilik yaptı. Bu tarihlerde Çaka Bey aynı zamanda Çanakkale yönlerine ilerlemiş ve Bizans'a ait Abidos'u kuşatmıştı. Selçuklu Devleti’nin Çaka Bey ile müttefik olmasının önüne geçmek isteyen Bizans imparatoru Aleksios Komnenos, Çaka Bey'in gerçek isteğinin İznik olduğu bilgisini yayarak I. Kılıç Arslan'ı kayınpederi olan Çaka Bey’ karşı kışkırttı. I. Kılıç Arslan, Çaka Bey'in sürekli güçlenmesini kendisi için bir tehlike olduğunu düşünerek Bizans ile müttefik oldu. Abidos kuşatması sırasında Bizans donanması Çaka Bey’e karşı denizden, Selçuklu ordusuysa karadan saldırıya geçti. İki devlet anlaşmış olmasından bilgisi olmayan Çaka Bey, I. Kılıç Arslan ile görüşme isteğinde bulundu. I. Kılıç Arslan, Çaka Bey’i kutlamalarla karşıladı. Kutlama yemeği sırasında kayınpederi olan Çaka Bey'i kılıcı ile öldürmüştür.